Het afweersysteem van ons lichaam is een natuurlijke bescherming tegen ziektekiemen en andere lichaamsvreemde stoffen die ons lichaam binnendringen. Het afweersysteem ziet een donorlong ook als een lichaamsvreemde stof en zal dus proberen het orgaan af te stoten. Om een afstotingsreactie te voorkomen gebruikt u na de transplantatie medicijnen die de werking van het afweersysteem onderdrukken.
Afstoting (of rejectie) kan op verschillende momenten na de transplantatie plaatsvinden, ondanks de medicijnen tegen afstoting die u gebruikt. We onderscheiden twee vormen van afstoting: