De eerste longtransplantatie werd in 1963 uitgevoerd in de Verenigde Staten. In het begin waren de resultaten slecht. De kans op overlijden of andere ernstige complicaties was groot. Daarom stopte het longtransplantatieprogramma.
In de jaren tachtig van de vorige eeuw startte het longtransplantatieprogramma opnieuw. Er waren inmiddels veel betere geneesmiddelen tegen afstoting ontwikkeld. Ook de chirurgische technieken waren verbeterd.
Op dit moment vinden wereldwijd meer dan 1500 longtransplantaties per jaar plaats.
In 1989 voerden artsen in het St. Antonius Ziekenhuis in Nieuwegein de eerste enkelzijdige longtransplantatie uit. In 1990 deden ze de eerste dubbelzijdige longtransplantatie.
Van 1991 tot 2001 werden longtransplantaties alleen in het Academisch Ziekenhuis te Groningen uitgevoerd.
In 2001 verleende de minister een vergunning aan een tweede centrum. In dit centrum werken het Universitair Medisch Centrum Utrecht, het St. Antonius Ziekenhuis in Nieuwegein en het Erasmus Medisch Centrum in Rotterdam samen. De longtransplantaties vinden plaats in het UMC Utrecht.