Bij ongeveer 1/3 van de microtiepatiënten bestaat er een Hemifaciale Microsomie. Dit is een onderontwikkeling van bot en weke delen aan de aangedane gezichtshelft. Microtie als onderdeel van Hemifaciale Microsomie is niet erfelijk. Evenals bij Treacher Collins is er een minder goede ontwikkeling van de gelaatsbeenderen en is er ook hier een probleem van de onderkaak. Ook de bovenkaak is onderontwikkeld. Naast de oorschelpafwijkingen, kan er ook een middenoorgeleidingsdoofheid bestaan. De intelligentie is meestal normaal. Verder zijn er ook vaak afwijkingen van de halswervels en een gespleten gehemelte en/of lip.