Diagnostiek naar een BK virus infectie berust op het kwantitatief aantonen van viraal DNA in urine, plasma of ander materiaal. Het bepalen van antistoffen tegen BK virus is niet zinvol:de seroprevalentie is al op jonge leeftijd zeer hoog en dit gaat gepaard zonder duidelijke symptomatologie. BK virus kan reactiveren in immuungecompromitteerde patiënten en is bijvoorbeeld geässocieerd met een interstitiële nefritis of een haemorrhagische cystitis
