Bacteriële vaginose wordt veroorzaakt door een verstoring van het bacteriële evenwicht in de vaginaflora. Door verschillende oorzaken kan de zuurgraad in de vagina verminderd worden waardoor andere bacteriën kunnen overleven(o.a. Gardnerella vaginalis). Er ontstaat een grijswitte fluor waarin soms gasbeletjes aanwezig zijn. Dit veroorzaakt een zurige (vislucht) geur. De vaginose kan symptoomloos zijn, maar kan ook jeuk en vaginale windjes veroorzaken.